MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azoarcus sp. KH32C plasmid pAZKH DNA

Total Repeats: 18076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_020548	CGA	2	6	734058	734063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204496
18002	NC_020548	GTA	2	6	734086	734091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204496
18003	NC_020548	TTG	2	6	734120	734125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204496
18004	NC_020548	TCC	2	6	734198	734203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204496
18005	NC_020548	CGG	2	6	734238	734243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204496
18006	NC_020548	TTG	2	6	734299	734304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_020548	CGG	2	6	734328	734333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18008	NC_020548	CCT	2	6	734432	734437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204497
18009	NC_020548	CGG	2	6	734477	734482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18010	NC_020548	CGC	2	6	734525	734530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18011	NC_020548	ATC	2	6	734563	734568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204497
18012	NC_020548	TCGG	2	8	734608	734615	0 %	25 %	50 %	25 %	470204497
18013	NC_020548	ATC	2	6	734620	734625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204497
18014	NC_020548	TCG	2	6	734651	734656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18015	NC_020548	CGT	2	6	734693	734698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18016	NC_020548	CGC	2	6	734771	734776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18017	NC_020548	GTC	2	6	734959	734964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18018	NC_020548	CGC	3	9	735026	735034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18019	NC_020548	GC	3	6	735098	735103	0 %	0 %	50 %	50 %	470204497
18020	NC_020548	GCC	2	6	735150	735155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18021	NC_020548	TGC	2	6	735253	735258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18022	NC_020548	GCCTTC	2	12	735262	735273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470204497
18023	NC_020548	CGACGT	2	12	735281	735292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18024	NC_020548	GTC	2	6	735300	735305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18025	NC_020548	ACC	3	9	735313	735321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204497
18026	NC_020548	CGTGC	2	10	735357	735366	0 %	20 %	40 %	40 %	470204497
18027	NC_020548	CGC	2	6	735404	735409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18028	NC_020548	CAG	2	6	735435	735440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18029	NC_020548	CGGC	2	8	735560	735567	0 %	0 %	50 %	50 %	470204497
18030	NC_020548	GATG	2	8	735575	735582	25 %	25 %	50 %	0 %	470204497
18031	NC_020548	CCG	2	6	735583	735588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18032	NC_020548	ATC	2	6	735610	735615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204497
18033	NC_020548	CGT	2	6	735618	735623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18034	NC_020548	ATC	2	6	735658	735663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204497
18035	NC_020548	GCA	2	6	735710	735715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18036	NC_020548	GCA	2	6	735788	735793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18037	NC_020548	CGG	2	6	735845	735850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18038	NC_020548	CGAG	2	8	735908	735915	25 %	0 %	50 %	25 %	470204497
18039	NC_020548	ACG	3	9	735957	735965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18040	NC_020548	GGC	3	9	735966	735974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18041	NC_020548	GAA	2	6	736017	736022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204497
18042	NC_020548	CGG	2	6	736073	736078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18043	NC_020548	CGCGC	2	10	736091	736100	0 %	0 %	40 %	60 %	470204497
18044	NC_020548	TCG	2	6	736103	736108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18045	NC_020548	AGC	2	6	736159	736164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18046	NC_020548	CGG	2	6	736201	736206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18047	NC_020548	TGC	2	6	736210	736215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18048	NC_020548	TTG	2	6	736246	736251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204497
18049	NC_020548	TCGA	2	8	736261	736268	25 %	25 %	25 %	25 %	470204497
18050	NC_020548	CGA	2	6	736274	736279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18051	NC_020548	GGC	2	6	736326	736331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204497
18052	NC_020548	GCC	2	6	736338	736343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18053	NC_020548	CGA	2	6	736499	736504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18054	NC_020548	GCA	2	6	736529	736534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18055	NC_020548	CGA	2	6	736580	736585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18056	NC_020548	CGC	2	6	736673	736678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18057	NC_020548	CCG	3	9	736712	736720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204497
18058	NC_020548	TCG	2	6	736729	736734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18059	NC_020548	AGC	2	6	736735	736740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18060	NC_020548	ATC	2	6	736777	736782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204497
18061	NC_020548	ACG	2	6	736885	736890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18062	NC_020548	TTC	2	6	736945	736950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204497
18063	NC_020548	G	6	6	737012	737017	0 %	0 %	100 %	0 %	470204497
18064	NC_020548	CGAT	2	8	737047	737054	25 %	25 %	25 %	25 %	470204497
18065	NC_020548	GCA	2	6	737087	737092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18066	NC_020548	CG	3	6	737094	737099	0 %	0 %	50 %	50 %	470204497
18067	NC_020548	TCG	2	6	737110	737115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18068	NC_020548	GTC	2	6	737139	737144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18069	NC_020548	GCT	2	6	737147	737152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204497
18070	NC_020548	GTTCAT	2	12	737187	737198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470204497
18071	NC_020548	TCG	2	6	737279	737284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204498
18072	NC_020548	TGG	2	6	737331	737336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470204498
18073	NC_020548	CGA	2	6	737367	737372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204498
18074	NC_020548	CCG	2	6	737427	737432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470204498
18075	NC_020548	TCG	2	6	737435	737440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204498
18076	NC_020548	ATG	2	6	737579	737584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204498

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.